2001年，山东大学医学院按照国家级实验教学示範中心的标準成立了医学基础实验教学中心，该中心位于山东大学西校区，隶属于医学院。为实现资源共享、促进学科交叉融合，提高实验教学质量，医学院对原隶属于各个学科的教学实验室进行了整合，构建了医学形态学、医学机能学、细胞及分子医学和临床基础四个医学基础实验教学平台和一个大学生开放创新实验室。四个实验教学平台下设人体解剖学、形态学、机能学、生物化学与分子生物学、细胞生物学与遗传学、医学微生物学与免疫学等六个基础教学实验室和实验核医学、诊断学、手术学、临床技能培训中心等4个专业实验室。