中介体在转录中扮演关键角色，被称为“转录中央控制器”。它是由几十个不同蛋白质组成的庞大的分子机器，由头部、中部、尾部3个稳定模组构成；其模组化结构和亚基组成从低等的酵母到高等哺乳动物高度保守。冷冻电镜是当前能够解析完整中介体三维结构的唯一方法。但受限于结构上的複杂性，已报导的电镜结构解析度很低，无法定位各个模组，甚至头部模组的晶体结构对接到中介体电镜结构的位置都不确定。原先对于中介体的模组化结构认识模糊，且与大量结构和功能实验数据相牴触，大大限制了对中介体精细结构和作用分子机制的认识。

蔡刚研究组长期专注于採用冷冻电镜解析中介体的结构和功能，相继解析了迄今唯一的中介体冷冻电镜三维结构（Structure2009）、首箇中介体头部模组三维结构（NatStructMolBiol2010）、首箇中介体头部模组与RNA聚合酶II的複合物的冷冻电镜三维结构（Structure2012）和中介体可解离Cdk8激酶模组的三维结构（ProteinCell2013）；此外，参与解析头部模组的首个晶体结构（Nature2011）。在此基础上，该研究组採取“庖丁解牛”的研究策略，将完整中介体肢解成各个模组和模组的组合，通过细緻比较中介体及其各个功能模组组合的精细三维结构，首次清晰划分了各个模组，重新定义了中介体的模组化的组织架构，颠覆了影响长达十余年的错误模组划分。

审稿人认为，“这项工作极大推进了对于中介体模组化结构的认识，为阐明中介体调控转录的分子机制打下了坚实的基础”。

上述研究工作得到了科技部“重大研究计画”、基金委“优秀青年基金”等项目的资助。