上述两只指数均综合考虑市值及股票流动性，剔除了无成交记录的挂牌公司;指数计算採用流通股本加权法;採用市值覆盖标準(不固定样本数)确定样本股数量;样本股选取综合考虑市值和股票流动性指标，按季度调整;指数样本股行业分类参照全球行业分类系统(简称GICS)标準;以2014年12月31日为基期，基点为1000点。

新三板指数包括“全国中小企业股份转让系统成分指数”(三板成指，899001)和股转系统做市成分指数(三板做市，899002)，新三板成指以2014年12月31日为基日，选取基日收盘后所有样本股的调整市值，基点为1000点。成为新三板成指的指数样本股，需满足“挂牌以来有成交”以及“流通股本不为零”两个条件，并按过去三个月日均成交金额和总市值的综合排名进行降序排列，按照市值覆盖全部挂牌公司总市值85%来确定样本数量。该指数从3月份开始每季度调整一次，样本股调整实施时间均为第二个星期五收盘后的下一个转让日。