2017年5月任国家食品药品监督管理总局综合司（国务院食品安全办秘书处）副司长。

2017年5月25日，国家食品药品监督管理总局党组研究决定，任命：邱琼同志为国家食品药品监督管理总局综合司（国务院食品安全办秘书处）副司长。