该系统于2014年1月10日全国联网试运行。教育部在完成首次信息採集后，为确保以学生身份基本信息为核心的数据準确，利用公安部人口信息管理系统及国家人口基础信息库对学生数据进行核查对比，对準确无误的核发全国唯一的正式电子学籍号。学生正式电子学籍号的发放，标誌着全国中小学生学籍信息管理系统进入新的套用阶段，将在中国小招生入学、学籍注册、学籍档案管理、学籍异动、升级、毕业、成长记录等方面发挥日益重要的作用。

学籍系统在教育管理中率先全面套用，联网试运行来取得了突破性进展，形成了良好综合效益。一是产生了广泛的管理效益。随着普遍开展套用，各级教育部门和中国小校正逐步习惯信息化管理模式，教育治理能力明显提升，教育治理体系不断完善。