妹之山残是CLAMP学园国小部学生会会长，鹰村苏芳和伊集院玲是学生会书记和会计，CLAMP学园是妹之山财团斥资兴建的，为日本未来输送最优秀人才，拥有最强大的财力和人力的学园都市，学园内设施齐全，从业者以及家族总计一万人左右在这里生活学习工作。三个人通过飞船来到东京铁塔前，确定了创立纪念派对的主会场，回到学校，受到女孩子们的追捧。小残回想起在塔里有一位女士在哭泣，非常在意。晚上来到东京塔，给刚刚看到的女士送花，安慰她，这时，女士受到了袭击，他们极力保护了她。说起原因，女士的丈夫的宅邸很值钱，却充满了两个人的回忆，她不想让出房子给小叔子，小残决定帮忙到底，并给坏人教训，而后，小叔子把女士骗到了东京塔，小残等人及时赶到，女士被逼到了东京塔外，他快掉下了塔，答应不再骚扰女士了。这时，小玲开着飞船赶来，救了坏人，同时送女士回家，她看到了梦想中的樱花铺成的粉红色的地毯，小残决定，成立CLAMP学园侦探团，由他们三人担当，为了解决女生的各种难题。

　　理事长找小残谈话，说了那位女士的感谢，对学生会成员的鼓励和一个任务的委託——寻找被偷的所有个人资料名单，第二天会议下午四点需要用，地点是理事长室，行动保密。所以这作为侦探团的第一个任务，也是一种挑战。理事长离开5分钟，密封空间，名单就不见了。虽然窗户是开着的，从天空落下来会被击落，沿着墙壁下来的话，进不来。理事长监视着他们的行动，并留下了猜错了的卡片。监控记录也没有可疑的地方。桌上的掉落的花瓣引起了小残的注意，通过提示，知道了名单是微型磁片,非常小的东西。第二日，小残已经明白了犯人其实是小鸟，并让苏芳提前準备好录下了小鸟的动作，并去巢里找回磁片，任务顺利完成。

　　这一日是小残的生日，数百的女生齐聚到小残的身边送他礼物，还包括一只小鸟。只有一个女生京极绿子，对小残非常不满，小残会在当天拆开看完女孩子们用心準备的礼物。其他女生为小残鸣不平，对绿子恶言相向，绿子借这个藉口向小残所在的侦探团挑战，如果失败，只能辞去学生会长一职，她在学园里收藏了某样东西，请小残一个人三日后下午六时前找到，小残给出的条件是看到绿子同学的笑容。小残一个人顶着雨各处寻找，绿子很担心也很感动，甚至不忍心让他继续找了，这时，小残刚好找到了，人在收藏东西的时候，总是选择熟悉的地方，绿子料理一个花坛，他生日当天绿子种了一株薰衣草，就是答案了。

　　小玲很擅长料理，经常教大学部的学姐们学习料理。一次在走廊里撞上了一个学姐工藤雪子，她很困扰的样子，并留下了一个没有吃过的苹果派。小玲很在意，通过描述特徵，询问会长了解了学姐的名字，并找到学姐，还给她一个新的苹果派。小玲偶遇雪子和海老原老师的不和。小残和苏芳也调查雪子的同学，雪子最近经常做苹果派。而海老师两周前说过喜欢吃苹果派，而雪子在课上说不想再做苹果派了。玲以为雪子是因为讨厌海老师才不做苹果派的，其实雪子是喜欢老师的，而雪子最喜欢的也是苹果派。那天，雪子鼓起勇气做好了苹果派去向老师表白，而老师刚好也做了苹果派请雪子吃，而雪子认为自己无论怎样做也比不上这个料理老师做的东西，因而没了信心。玲劝说，给喜欢的人做料理的心情才是最重要的。玲鼓励雪子再尝试一次，并和她一起做，雪子再次去了海老师的办公室，两个人互通了心意，原来老师也一直喜欢着雪子。

　　小残很喜欢夏天，三年前苏芳和小残之间发生了一些玲不知道的秘密。小残让苏芳取来了有纪念意义的企鹅，苏芳告诉了玲要给会长準备三丁目公园的冰棍。三年前，学生会成员还没决定，二年的苏芳也很抢眼，是弓道大会优胜者，女生请求苏芳和小残合影一张。苏芳很在意小残这个人，母亲却提醒苏芳一直保持武艺。一日放学，小残叫住苏芳，邀他吃冰棍，小残坦白了调查了苏芳的事，这时有人围攻小残，苏芳来救，被一起带走了。小残被带到了别墅，苏芳被锁在了牢房里。