路易莎出生于那不勒斯的皇宫里。她的父亲是未来两西西里的国王斐迪南一世，她的母亲则是奥地利女大公玛丽娅·克洛琳娜，法国皇后玛丽·安托瓦内特的姐姐。她的祖父母是西班牙国王查尔斯三世和萨克森公主玛丽娅·阿玛丽娅；她的外祖父母是神圣罗马帝国皇帝弗朗茨一世和奥地利皇后玛丽娅·特蕾莎。