学院下设食品科学与工程、生物工程、食品质量与安全 3个系，2个院级教学实验中心（包括8个基础实验室和3个食品加工中试工厂），食品科学与工程、生物工程和食品质量与安全3个本科专业，拥有1个博士后流动站（食品科学与工程），1个农业部重点开放实验室（农畜产品加工与质量控制），2个博士点（食品科学、生物工程），4个硕士点（食品科学、发酵工程、农产品加工及贮藏工程和粮食、油脂及植物蛋白工程），7个校级研究室。

学院承担国家自然科学资金、部省级课题及横向课题研究80多项，荣获国家和部省级科技进步奖10多项，获国家专利5项，有3项成果分别获国际博览会金奖、首届农业博览会金奖和全国轻工博览会金奖，在国际学术刊物上发表论文100余篇（其中80篇被SCI、EI等收录和引用），国内学术刊物上发表论文1000余篇，出版专着11部，教材11部。国家一级学会----中国畜产品加工研究会挂靠学校，设在本院，编辑出版《中国畜产与食品》杂誌。学院注重科研成果的开发与转化，先后在江苏、福建、安徽、北京、甘肃、江西等地取得了显着的社会效益和经济效益。

学院注重拓展海内外科技合作关係，曾多次承办大型学术会议，接待美国、日本、加拿大、荷兰、澳大利亚等前来讲学的专家教授 50多人次，派出国外进修、访问、攻读学位的教师40余人次。

党委书记：董明盛

院长：徐幸莲

副院长：屠康、李春保、辛志宏

党委副书记：朱筱玉

“十·五”期间学院从国外引进人才2名，新增教授7名。学院教职员工总数50人，任课教师31人，其中教授14人，副教授14人，副高以上职称的教师占其总数80%，博士生导师13人，硕士生导师18人，具有博士、硕士学位的教职工占80%以上。教师队伍中年龄在45岁以下的占90%以上。2002年学院被评为江苏省高校“青蓝工程”省级优秀学科梯队。