1994年，为纪念中国计算数学的先驱和创始人、中国科学院院士冯康对中国计算数学事业所做的杰出贡献，中国科学院计算数学与科学工程计算研究所决定设立冯康科学计算奖。

1995年，冯康科学计算奖首次颁发。

冯康科学计算奖奖励在科学计算领域做出突出贡献、年龄不超过50岁（指评奖年1月1日未满50周岁）的海内外华人科学家。该奖每两年颁发一次，每次最多遴选两位获奖人，奖金额每位人民币叄万元整（根据情况适当调整），同时颁发荣誉证书（2016年11月1日开始生效）。

中国科学院数学与系统科学研究院是“冯康科学计算奖”的依託单位，其下属的计算数学与科学工程计算研究所（以下简称计算数学所）具体负责奖励基金的筹措管理和评奖的组织管理。该奖的评选工作由“冯康科学计算奖”评奖委员会负责。该奖的评奖委员会由九位海内外知名计算数学家组成。评奖委员会委员由计算数学所学术委员会在广泛徵求意见的基础上提名，经计算数学所所务委员会批准，报依託单位备案。评奖委员会每届任期两年，每届至少更换三分之一（含三分之一）委员，每位委员最多可连续任三届。如遇特殊情况，每届任期之内可做适当调整。计算数学所每两年公布奖励基金的筹措及使用情况，捐款人对奖励基金的使用与评奖的组织管理具有监督权。每一奇数年的3月15日是申请和推荐截止日期。同年9月底前公布获奖人员名单。

符合冯康科学计算奖条件者可本人提出申请，但需有5名教授（或同等职称专家）的推荐信，评奖委员会委员不得作为推荐人，推荐信由推荐者直接寄到“冯康科学计算奖”工作办公室。

1995年冯康科学计算奖首次颁发。截至2017年7月，冯康科学计算奖共评选了12届，共有28人获得该奖项：

旨在奖励在科学计算领域做出突出贡献的海内外华人科学家。

冯康科学计算奖的获奖者都是中国国内外计算数学界中青年数学家中的佼佼者。（中国科学院评）