1991年经农业部批准增挂“农业部新疆勘测设计院”。自1998年以来一直被评为自治区勘测设计行业二十强单位（2004年排名第二位）。

兵团设计院根据时势的需要，先后曾有过七次变动。1984年恢复组建了师级建制，院机关由此从大泉沟迁至石河子市。1991年经农业部批准增挂了“农业部新疆勘测设计院”的牌子。2000年 经批准更名为“兵团勘测规划设计研究院”。2004年7月院机关及乌市片区生产单位已搬进乌鲁木齐市建设路26号新建28层办公楼办公，工作环境焕然一新。

现状： 全院现有在职员工近千人。下辖16个处级生产经营单位，分居乌鲁木齐和石河子两地。

资质：拥有农林、水利、建筑、谘询、环评、工程勘察、测绘、监理、工程总承包和工程招投标代理等13个甲级资质证书和水电、公路、城市规划、旅游规划、岩土等15个乙级资质证书，是全国农业系统规模大，资信高，专业门类齐全，技术力量雄厚，先进装备匹配，综合效益可观的综合类甲级勘测设计单位。

技术装备：现一线工作人员及管理人员计算机达到人手1.3台。先进网路设备、宽幅彩喷绘图机等输出设备；GPS等测绘设备；大型绘图仪等出版设备；数位化成图等软体应有尽有，并建立了CAD图文工作站、3S系统工作站，整体提高了技术装备水平和科技含量。馆藏图书、资料、档案、彩图、期刊等30余万册(件、本、套)。

远程管理：目前，已经开通院内“三网合一”即石河子片区的两个区域网路和乌鲁木齐片区区域网路合一实现了音频、视频、数据传输的统一，解决了长期以来由于分居两地而带来的诸多不便和由此带来管理成本增加的问题。特别是解决了乌石两地项目技术成果交流、讨论困难的问题，为提高我院工作效率、人力资源的有效利用和各方面管理的提升奠定了硬体基础。

质量认证：已获得并保持着ISO质量体系认证证书。今天的兵团勘测规划设计研究院办公场所得到改善，先进设备成龙配套，职均收入逐年增加，企业信誉不断提高，三个文明健康发展，职工队伍安定团结。

企业效益：2008年全院人数最少的一个分院的产值是800余万人民币。

单位性质：正厅级（省级）事业单位，（正在改企当中）

最新动向：2008年底，成立规划分院，人员主要由原来二分院的注册规划师、高级规划师以及新近招收的一批国家重点大学的毕业生等组成。

下属的近20个部门中效益最好的前四个是：公路分院、二分院（水利分院）、环境评估中心、恆信造价（2008年数据）