福建工程学院海峡工学院，是福建省教育厅批准福建工程学院设立的二级教学机构（闽教高【2010】91号），统筹管理闽台合作项目，统一组织教学工作。2012年3月9日更名为海峡工学院（原先为闽台科技学院）。学院实施普通高校本科学历教育，採用“分段对接”合作培养模式，引进台湾高校的优质课程体系、教学管理经验和国际化师资，整合优质教育资源，实现强强互补，採用“3+1”、“4+0”分段对接模式，在大力实施普通高校本科学历教育的基础上，着力为区域经济建设培养具有创新精神和实践能力的套用技术型专门人才。办学成果获得专家学者的一致好评。

七年来，福建工程学院海峡工学院师生上下齐心，精诚团结，勇于拼搏，在师生的共同努力下，办学成效逐年提高，学生的创新意识、实践能力和人文素养不断提高，在校级以上各类活动和学科竞赛中取得不少优异成绩，并先后获得省级以上重要荣誉50余项，并得到省内和社会多家媒体的综合报导，越来越受到社会各界的关注。随着福建工程学院闽台高校联合培养人才项目办学成效的不断提升，闽台合作项目培养了越来越多的德才兼备人才走向社会，服务社会，为地方区域经济社会发展注入了新的活力。