明洪武二十年（1387年）江夏侯周德兴，以三丁抽一为兵，防备倭寇，

将永宁卫底下左、右、中、前、后千户所里的中、左千户所士兵调驻嘉禾屿，设中左守御千户所，于洪武二十一年（1388年）建置完成。至于城池则约为洪武二十七年（1394年）时建成。厦门城原周长1360米、高6米，基广约2.9米，设4个城门、22个窝铺。城门4座依次为东“启明”门、西“怀音”门、南“洽德”门、北“潢枢”门。移永宁卫中、左千户所官兵驻军1240名戍防，厦门至此有“中左所”之称，属福建都指挥使司。与金门所城、高浦所城、以及永宁卫城、镇海卫城互为犄角，巩固了海防。

中左守御千户所城

明永乐十五年（公元1417年），城墙增高为2.2丈(7米),四城还增设月城。明正统八年（公元1443年），加筑敌楼四座。

景泰三年（1452年），原设于金门所的浯屿水寨因为巡抚焦宏认为“孤悬海中”而迁到中左所，但仍用旧名，直到万曆三十年（1602年）又因为距离崇武所太远而迁到晋江石狮。万曆二十年（1592年）福建南路参将移驻于此。

隆庆四年（1570年）设浯铜游兵，驻于中左所，有兵536人，由浯铜把总一员管辖，卫所又贴驾军三百名，哨船二十艘。

南明永曆九年（1655年），郑成功将中左所改为思明州，设定六官。

中左守御千户所城

清康熙20年（1681年），清军在与南朝郑氏政权的对抗中将城摧毁，至康熙22年（1683年）收复台湾后开始由福建水师提督、靖海侯施琅重修重建，并将城墙周长扩至1920米，城墙增高至9.6米。康熙24年，旧的城墙被拆除重新扩建，城墙周围长约2000米。清乾隆十七年（公元1752年），第二次重修，进行扩建。

鸦片战争时，英军攻占厦门城，城垣遂逐渐废。到20世纪初，其城墙仍依旧完好，内外城仍轮廓分明。直到1919年，由林尔嘉任会长的厦门市政会倡议开闢马路，方便交通，厦门古城墙及附属设施大部分被陆续拆除。厦门城仅存北面城墙一段，总长约80米，西北至东南走向，墙残高2-7米，呈斜坡状，顶宽3.5-6米。墙体两侧以花岗岩条石乾砌而成，中部以三合土填筑。条石长1.4米，宽0.28米，高0.3米，以横、纵相间的形式排列。

1961年厦门城遗址由厦门市政府公布为第一批市级文物保护单位；

1983年厦门市人民委员会重新公布为第一批市级文物保护单位；

1994年，在厦门建城600年之际，市政府拨款15万元对古城墙进行维修，修复城墙64米，复建城垛28个，清理环境，立碑建亭，铺造通路，并召开了“纪念厦门建城600周年大会”；

2003年8月，市文化局召开发布会，表示将在这段明古城墙基础上建一个城址博物馆；

2004年08月04日，厦门市文物管理委员会召开第二次扩大会议，会上决定厦门城遗址将申报全国重点文物保护单位、第六批省级文物保护单位。

2005年05月厦门城遗址被列入第六批福建省级文物保护单位。

厦门城岩壁上，有清代福建水师提督杨歧珍题写了“山环水活”四个大字，山环，指的是古城东面有玉屏山，北面有万石岩，西面有狐尾山；而水活，则是向南面对着大海，时而碧波万顷，时而惊涛拍岸。

在厦门城遗址，有两处甘国宝的题字刻石，相距约10米。为乾隆二十六年（1761年）六月，甘国宝任福建全省水师提督时驻节厦门提字：

一为“瞻云”二字，隶书横刻，字径0.5米；右侧直题“乾隆辛巳荔月”；左下方直书“甘国宝题”，均楷书。康熙二十三年（1684年），首任福建水师提督施琅在“厦门城”内建提督署，署中有澄心堂、足观堂、八风亭、方池、怪石诸胜。瞻云两字意即此地居高可以瞻望风云变幻。一说乃借《史记》称讚帝舜“其仁如天，就之如日，望之如云”之典，寓歌颂“康乾盛世”之义。

一为“曼倩偷”三字，刻在一块状似仙桃的岩石上，字径0.4米；左侧署“和庵”，行书。曼倩偷这个碑刻引用了东方朔偷桃的典故。东方朔（前154—前93年），字曼倩，西汉文学家，平原厌次（今山东惠民）人，武帝时为太中大夫。性诙谐滑稽，善辞赋，《答客难》为代表作。后代关于他的传说很多，并将他编写成仙人。神话中是太白金星的化身，王母娘娘的蟠桃三千年一结果，东方朔就曾偷了三次。

城墙最高点有宽阔平台1处，面积约100平方米，此为厦门城最高处，檯面上的高炮掩体设施为厦门解放初期驻军所筑造，用于架设高射炮，防备国民党军的飞机来轰炸。

中左所城平面呈环形，初建时周长425丈（约1360米），高连女墙1丈9尺（约6米），开四门，依次为东启明、西怀音、南洽德和北潢枢，设有窝铺22个、城垛496个，营房987间，屯驻1240名士兵。墙体内部夯土，外皮以花岗岩条石“丁顺”垒砌。永乐、正统和万曆年间曾加修葺。清康熙二年（1663年）总督李率泰堕城，康熙二十四年（1685年）靖海侯施琅重建，周长扩为600丈（约1920米），乾隆十七年（1752年）再次重修。

1919年因市政建设城墙大部分被拆除，仅存北城门遗蹟和残墙两处，位于今厦门市公安局北侧的出米岩山上，其中城北残墙长120米，残高1.5-4.5米，顶宽3.5米；东北残墙长1.5米，高1.7米。墙上存有摩崖石刻“瞻云”、“曼倩偸”（均为乾隆时甘国宝所题）和“山环水活”（光绪时杨岐珍所题）。1994年为纪念厦门建城600周年修复城墙64米并复建城垛。

城内的明代庙宇原有城隍庙、东岳庙、真武庙等