博雅学院直属中山大学人文高等研究院领导，博雅学院院长由“逸仙学者”讲座教授、人文高等研究院院长甘阳教授担任。人文高等研究院利用其广泛的海内外学术联繫，广邀海内外学者为博雅学院讲授课程或开设系列讲座。

博雅学院强调精英教育，但这不意味任何特权，而仅仅意味更多的阅读，更多的思考，更多的付出，且将来承担更大的责任。博雅学院推崇的人生价值不是金钱，而是智慧与修养。博雅学院学生的人生榜样不是亿万富翁，而是学富五车的大思想家，大学问家。

博雅学院本科学制实行四年不分专业的精英化博雅教育方案，贯彻跨学科跨领域的精英教学方式，着重培养今后有能力从事高深学术研究的人文艺术和社会科学精英人才。学院的教学方案参考国外博雅学院（Liberal Arts College）的经验，课程设定贯彻“少而精”的原则，每学期主要课程一般为4-5门，但每门课有大量阅读和作业。学生在四年本科期间将广泛深入地研修中西方文明传统及其经典着作，必修古汉语、古希腊语、拉丁语等古典文明语言，兼修艺术理论及其技能，毕业学生将获得哲学（博雅）学士学位。博雅学院优秀本科毕业生将有机会直接入读本院研究生班。