《基础学科拔尖学生培养试验计画进展报告(2009.01-2011.12)》共五部分，内容包括：主要档案和领导讲话；基础学科拔尖学生培养试验计画实施办法；调研论证；关于创新人才培养开发机制的论证报告；各校实施方案；实施进展；总体进展和专家组谘询报告等。