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马剑鹏

(2021-07-03 10:00:04) 百科综合
马剑鹏

马剑鹏

马剑鹏，男，1964年11月出生，1985年毕业于复旦大学化学系获学士学位，1996年毕业于美国波士顿大学获化学博士学位，1996—2000年于哈佛大学化学系从事博士后研究。2000年起担任美国贝勒医学院生物化学和分子生物学系及莱斯大学生物工程系助理教授，2008年晋升为教授。2011年起担任清华大学生命科学学院教授，博士生导师。

美国医学生物工程学会会士，美国科学促进会会士，美国物理学会会士，Norman Hackermann 化学研究奖获得者。2018年作为上海市高峰人才引进团队的核心成员加盟复旦大学，与 Michael Levitt 教授一起创立复旦大学MRICS并任院长。

基本介绍

  • 中文名：马剑鹏
  • 外文名：Jianpeng Ma
  • 国籍：中国
  • 出生日期：1964年11月
  • 毕业院校：复旦大学，波士顿大学
  • 主要成就：美国科学促进会会士
    美国物理学会会士
    Norman Hackermann 化学研究奖获得者
  • 职称：教授
  • 性别：男

教育工作经历

1981－1985年，就读于射定精复旦大学化学系，获化学学士学位
1990－1996年，就读于美国波士顿大学，获化学博士学位
马剑鹏
1996－2000年，哈佛大学化学系博士后
2000－2004年，贝勒医学院生物化学和分子生物学系及莱斯大学生物工程系助理教授
2004－2008年，贝勒医学院生物化学和分子生物学系及莱斯大学生物工程系副教授
2008－2010年，贝勒医学院生物化学和分子生物学系及莱斯大学生物工程系教授
2011年起，清华大学生命科学学院教授，博士生导师。
2018年作为上海市高峰人才引进团队的核心成员加盟复旦大学，与 Michael Levitt 教授一起创立复旦大学MRICS并任院长。

研究领域与方向

计算生物学：全力发展新的计算方法来模拟生物体系，改良结构建模，和準确埋提市预测蛋白质和核糖核酸结构。
细胞和结构生物学：利用生物化学、分子生物学、细胞生物学、发育生物学艰鸦厦和生物信息学等多学科技术手段研究肌球蛋白的信号传递以及表观遗传因子在胚胎干细胞和肿瘤细胞发育中的作用。

研究成就

马剑鹏博士的研究领域为生物物理，计算生物学及结构生物学。主要致力于发展针对生物体系研究的新的计算方法，用以克服实验研究中的困难，与实验手段相结合解决複杂生物体蒸故料应系中的重要问题。他的研究在中低精度蛋白质结构与功能以及蛋白质摺叠研究领域内处于前沿和主导地位。汗捉估燥他发展的包含大尺度运动的多尺度多精度结构精化的方法大大推进了X光晶体衍射，低温电子显微镜和纤维衍射领域中柔性结构分子的精化。他最新发展的计算方法成功地套用于中等大小蛋白的摺叠问题。马剑鹏博士课题组近年来在Nature, Science, Proc. Natl. Acad. Sci., Biophys. J.,J. Am. Chem. Soc.等国际着名杂誌上市备发表论文53篇，并多次在国际学术会议上做邀请报告。因其在计算生物学和结构生物学领域的重要贡献，2004年获得 Norman Hackerman 化学研究奖。

所获荣誉

1997－1998年，Burroughs Wellcome Fund PMMB 博士后奖学金
1998－2000年，National Institutes of Health 博士后奖学金
2003－2005年，中国国家自然科学基金会中国海外杰出青年基金B类
2003－2008年，美国国家自然科学基金会Faculty Early Career Development (CAREER) Award
2004年，美国Welch基金会 Norman Hackerman Award in Chemical Research
2007年，地艰整入选 American Physical Society 会士
2008年，入选American Association for the Advancement of Science (AAAS) 会士
2008年，贝勒医学院Michael E. DeBakey Excellence in Research Award

代表性论文

  1. Yinghao Wu andJianpeng Ma(2004). Refinement of F-actin Model Against Fibre Diffraction Data by Long range Normal Modes.Biophys. J.86:116-124.
  2. Jacob Brink, Steven J. Ludtke, Yifei Kong, Salih J. Wakil,Jianpeng Maand Wah Chiu (2004). Experimental Verification of Conformational Variation of Human Fatty Acid Synthase as Predicted by Normal Mode Analysis.Structure12:185-191.
  3. Jianpeng Ma(2004). New Advances in Normal Mode Analysis of Supermolecular Complexes and Applications to Structural Refinement.Curr. Prot. Pept. Sci5:119-123(Invited review).
  4. Terence C. Flynn andJianpeng Ma(2004). Theoretical analysis of twist/bend ratio and mechanical moduli of bacterial flagellar hook and filament.Biophys. J.86:3204-3210.
  5. Yifei Kong, Xing Zhang, Timothy S. Baker andJianpeng Ma(2004). A Structural-informatics Approach for Tracing b-sheets: Building Pseudo-Ca-traces for b-strands in Intermediate-Resolution Density Maps.J. Mol. Biol.339:117-130.
  6. Arjan van der Vaart,Jianpeng Maand Martin Karplus (2004). The Unfolding Action of GroEL on A Protein Substrate.Biophys. J.87:562-573.
  7. Qiang Cui, Guohui Li,Jianpeng Maand Martin Karplus (2004). A Normal Mode Analysis of Structural Plasticity in the Biomolecular Motor F1-ATPase.J. Mol. Biol.340:345-372.
  8. Yinghao Wu andJianpeng Ma(2004). Normal-mode-based Refinement of an F-actin Model Against Fibre Diffraction Data.Fibre Diffraction Review12:25-28 (Invited review).
  9. Martin Karplus, Yi Qin Gao,Jianpeng Ma,Arjan van der Vaart, and Wei Yang (2005). Protein Structural Transitions and Their Functional Role.Phil. Trans. R. Soc. A363:331-356.
  10. Jianpeng Ma(2005). Usefulness and Limitations of Normal Mode Analysis in Modeling Dynamics of Biomolecular Complexes.Structure13:373-380.
2003－2008年，美国国家自然科学基金会Faculty Early Career Development (CAREER) Award
2004年，美国Welch基金会 Norman Hackerman Award in Chemical Research
2007年，入选 American Physical Society 会士
2008年，入选American Association for the Advancement of Science (AAAS) 会士
2008年，贝勒医学院Michael E. DeBakey Excellence in Research Award

代表性论文

  1. Yinghao Wu andJianpeng Ma(2004). Refinement of F-actin Model Against Fibre Diffraction Data by Long range Normal Modes.Biophys. J.86:116-124.
  2. Jacob Brink, Steven J. Ludtke, Yifei Kong, Salih J. Wakil,Jianpeng Maand Wah Chiu (2004). Experimental Verification of Conformational Variation of Human Fatty Acid Synthase as Predicted by Normal Mode Analysis.Structure12:185-191.
  3. Jianpeng Ma(2004). New Advances in Normal Mode Analysis of Supermolecular Complexes and Applications to Structural Refinement.Curr. Prot. Pept. Sci5:119-123(Invited review).
  4. Terence C. Flynn andJianpeng Ma(2004). Theoretical analysis of twist/bend ratio and mechanical moduli of bacterial flagellar hook and filament.Biophys. J.86:3204-3210.
  5. Yifei Kong, Xing Zhang, Timothy S. Baker andJianpeng Ma(2004). A Structural-informatics Approach for Tracing b-sheets: Building Pseudo-Ca-traces for b-strands in Intermediate-Resolution Density Maps.J. Mol. Biol.339:117-130.
  6. Arjan van der Vaart,Jianpeng Maand Martin Karplus (2004). The Unfolding Action of GroEL on A Protein Substrate.Biophys. J.87:562-573.
  7. Qiang Cui, Guohui Li,Jianpeng Maand Martin Karplus (2004). A Normal Mode Analysis of Structural Plasticity in the Biomolecular Motor F1-ATPase.J. Mol. Biol.340:345-372.
  8. Yinghao Wu andJianpeng Ma(2004). Normal-mode-based Refinement of an F-actin Model Against Fibre Diffraction Data.Fibre Diffraction Review12:25-28 (Invited review).
  9. Martin Karplus, Yi Qin Gao,Jianpeng Ma,Arjan van der Vaart, and Wei Yang (2005). Protein Structural Transitions and Their Functional Role.Phil. Trans. R. Soc. A363:331-356.
  10. Jianpeng Ma(2005). Usefulness and Limitations of Normal Mode Analysis in Modeling Dynamics of Biomolecular Complexes.Structure13:373-380.

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