2003年，《中国水土保持科学》创刊，季刊。

入编新版《中文核心期刊要目总览》

2004年，该刊入选中国科技核心期刊。

2005年，该刊由季刊改为双月刊。

2014年12月，该刊成为中国原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。同年该刊入选《中文核心期刊要目总览》2014年版（即第七版），由北京大学出版社正式出版。

2017年，《中国水土保持科学》2017年主编会议在陕西杨凌召开。

《中国水土保持科学》主要设有设基础研究、套用研究、开发研究、学术论坛和研究综述等栏目。

1、基础研究：刊登土壤水蚀、风蚀、重力侵蚀以及山洪土石流侵蚀过程及其机制，土壤侵蚀模型，土石流和滑坡灾害发生机制与时空分布规律、流域产流产沙特徵，大尺度水土流失与水土保持的格局与规律，生态系统的稳定性与可持续性及其退化过程的动态监测、模拟、预警，与水土保持相关的水文、土壤、气象、植物生理等方面的研究报告，以及现代控制理论分析及跨学科的水土保持科学基础理论研究报告。
2、套用研究：刊登小流域综合治理及荒漠化防治工程技术，土壤侵蚀有关的监测、预报及信息化建设，水土保持方案、水土保持监测、水土保持监理、水土保持验收评估，退化生态系统的恢复与重建技术体系，山洪、土石流、滑坡等灾害综合防治技术等方面的研究报告。
3、开发研究：刊登水土保持与荒漠化防治领域的创新性技术、产品、方法、材料，为适应当今信息化时代的要求，以及探讨水土保持大数据建设，云计算，智慧水土保持与荒漠化生态系统的研究报告。
4、学术论坛：旨在为水土保持与荒漠化防治学科搭建一个学术交流平台，刊登学术创新成果、名师专业点评、热点话题探讨等方面的研究报告，以及探讨就水土保持与荒漠化学科的焦点问题、争议问题的研究报告。
5、研究综述：刊登水土保持学科某一主题中国国内外研究进展、研究现状、研究内容、相关特徵、以及与该主题相关研究的优缺点，取得那些研究成果，进行系统分析和梳理的研究报告。

《中国水土保持科学》主要刊登水土保持科学理论和技术方面的研究成果，包括土壤水蚀、风蚀、重力侵蚀以及山洪土石流侵蚀规律，土壤侵蚀监测与预报，防治水土流失的农业、林业与工程措施及小流域综合治理技术，乾旱地区土地退化机制与荒漠化综合防治技术，在水力、重力侵蚀混合作用下山地灾害发生机制与山洪、土石流、滑坡灾害综合防治技术，水土保持规划、设计、施工技术与效益评价，以及与水土保持相关的新产品、新技术、新方法和新材料等。

据2019年4月期刊官网显示，《中国水土保持科学》第四届编辑委员会拥有委员73人。

2010年8月14日，《中国水土保持科学》“第二届编辑委员会第二次会议”在北京召开。

2012年12月2日，《中国水土保持科学》创刊十周年纪念座谈会暨第三届编委会第一次会议在海南三亚召开。

2016年4月9日，《中国水土保持科学》编委会换届暨第四届编委会第一次会议在北京召开。

据2019年4月20日中国知网显示，《中国水土保持科学》出版文献共2169篇。

据2019年4月20日万方数据知识服务平台显示，《中国水土保持科学》载文量为2042篇，基金论文量为1622篇。

据2019年4月20日中国知网显示，《中国水土保持科学》总被下载528274次，总被引29138次，（2018版）複合影响因子为1.401，（2018版）综合影响因子为1.021。

据2019年4月20日万方数据知识服务平台显示，《中国水土保持科学》被引量为23597次，下载量为66175次，据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《中国水土保持科学》影响因子为0.90，在全部统计源期刊（6735种）中排第1257名，在农业基础科学类排名（25种）中排第14名。

时刻跟蹤水土保持领域的新进展、新理论、新技术和新成果，为水土保持生态建设提供有力的理论依据和技术支撑。

《中国水土保持科学》历任主编分别为：中国工程院院士关君蔚教授、国家级突贡专家王礼先教授、北京林业大学周心澄教授。