本系统是我们根据古生物学学科的特点,经过广泛调研后建立的古生物学专业资料库。这一系统切合了古生物学与相关学科的国际前沿和热点研究,并综合考虑了未来的长期发展需要。数据的来源主要是过去100 多年里发表的关于中国化石记录的文献资料,我们按照一定的标準规範将各类数据资源信息化,并经过学科专家的加工,以提高其科学价值。在数据内容上,以中国华南、塔里木和华北这三个中国最大的古板块、也是中国油气勘探的三个主要地区的化石记录和相关条目为主,时代上重点选择古生代这一与中国油气的“生储盖”(生成、储藏和盖层)密切相关的时期;涵盖了相关的文献数据、化石分类信息数据(Taxonomy)和化石产出记录数据(Collection),以及相关的剖面数据如地理位置、岩石信息等。在过去的两年里,数据条目基本保持每天持续更新,累计新添数据条目6 万多条。这些数据基本涵盖了古生物学科学研究所必需的数据信息,与现有的国际同类资料库相比,所涉及的内容和涵盖的学科领域均达到了国际前沿水平,可以充分满足古生物学研究近期和未来的研究需求。
基本介绍
- 中文名:中国古生物学专业资料库
- 类型:系统
- 研究:生物学
- 方式:提供文字查询方式
内容简介
由于本项目直接面向科研服务,因此,结合相关的热点科研套用,以及古生物学的数据特点,由科学家参与制定了一系列相关的数据质量控制和关係措施,通过这些措施,可以大大提高数据质量与科学价值,并提升资料库对科学家的吸引力。具体措施包括:对建库人员分级,不同级别的用户拥有不同的许可权,由学科专家对数据质量负责;从科学家的需求出发,根据古生物学的数据特点,儘可能依据国际标準确立相应的数据标準,确定相关栏位;建立数据厘定机制,由相关的学科专家负责对每一数据条目的厘定和加工,从而提升数据的科学价值,以利于科学研究。此外,针对古生物学研究的不同主题,採用WEB SERVICES 技术,集成和开发了一系列服务于古生物学科学研究和生产套用的数据挖掘、可视化和处理分析的网路服务工具,包括地理可视化与分析工具GeoVisual 的开发,地层信息可视化工具TimeScale Creator(美国Purdue 大学Ogg 教授等开发)的集成、定量地层对比软体CONOP 9(美国加州大学Sadler 教授开发)的集成等。
资料库现提供线上共享服务,共享方式为分级共享。这一分级共享体系是我们对国内外的学者进行了较为详细和广泛的调研后,建立的符合用户需求以及资料库发展要求的体系。概括来说,所有的数据分为两类,一类是全公开数据,一类是数据拥有者(数据集成者)可设定共享许可权的数据。前者如文献信息、分类信息等常用信息,后者如化石的具体产出层位、专家的附加厘定信息等。对于第二类数据,数据的拥有者可根据用户的许可权以及贡献度的不同等,决定数据的共享许可权,如完全公开、工作组内共享、研究组内共享、个人私有等。资料库本身为科学家提供免费服务,不收取任何费用。
由于资料库面向国内外的用户,因此我们提供7×24 小时的线上服务,并保证99% 以上的网路联通率。
使用方法
本系统目前针对三个大的数据子集均提供文字查询方式,包括文献搜寻,分类信息搜寻,以及化石产出记录搜寻。其中化石产出记录是最重要的搜寻功能,用户可藉此查询详细的化石记录,包括产地信息(国家、省、市、县、村、剖麵点)、经纬度数据、地层信息(如岩石地层、生物地层、年代地层等)、共生化石信息等。用户可将搜寻的结果存入自己的线上数据目录中。当用户通过一系列的搜寻,并将结果存入线上数据目录中,最终将可生成其专属的数据子集。例如,用户想要研究华南五峰组海相烃源岩的时空分布,可通过一系列的搜寻,最终生成一个由100 多个剖面组成的数据子集,然后利用系统中集成的数据可视化和分析工具进行科学分析,例如,利用GeoVisual 查看剖面的分布情况;利用TS Creator 查看单个剖面的岩石地层和生物地层信息,或者多个剖面间的对比;利用CONOP 进行地层的自动複合和生成多样性曲线等。用户也可选择将数据以表格形式下载至本地硬碟,自行分析。
套用案例
本系统自上线以来,已经配合973 项目、国家自然科学重点基金和面上项目、中科院创新方向性项目等提供了一系列数据服务。例如:
1. 华南奥陶- 志留纪黑色烃源岩的时空分布分析。此项研究的主要目的是配合中国油气勘探的需要,进行中国与油气相关的重要地层的普查工作。资料库方面与之配套的一个工作就是建立相应的五峰组和龙马溪组黑色页岩的分布资料库,并利用线上可视化和地理分析工具GeoVisual 分析南方奥陶- 志留系的两套重要烃源岩的时空分布模式。
2. 华南二叠纪生物多样性研究。根据973 项目的需要,我们配合科学家收集、整理、集成了华南二叠纪的数十条剖面数据,建立资料库,并利用集成的CONOP 功能进行剖面生物地层信息的综合与多样性分析。
持续发展
中国古生物学专业资料库现在是中科院南京地质古生物研究所和现代古生物学与地层学国家重点实验室的重要发展方向之一,因此得到了相关部分的大力支持以及长远支持。资料库的用户既包括国内学者,也包括了部分国外用户。通过这一资料库,一些广泛的国际合作已经在开展之中,涉及古生物地理、古生物多样性、地层的洲际对比等。迄今为止,资料库中集成的数据以中国数据为主,但很快将转向国际。
