寺院北依色尔腾山，向南遥望乌拉山为藏族建筑风格，占地约12.6公顷。寺院的建筑包括东西禅修中心、9处殿宇、以及上师楼、弘法大厅及住宅等，房屋总计达百余间。

大中寺建筑格调独特，山门、防风墙等多以藏式和古宫殿式的混合结构为主，菩提塔、八塔、转经路等大型建筑尚在续建当中。寺院三进：大悲殿、度母殿、菩萨殿，青砖砌筑寺院围墙。大悲殿前两侧浇筑字样"国泰民安，风调雨顺"。

寺院东西角花墙独成一院，为东西禅修中心，精美壁画与彩绘交相呼应，西禅院投资百万余元修建的闭关洞，在山体内铁矿石砌筑而成，穹顶飞天仙女，地面铺设电气石、玉石，装修古朴典雅，古香古色中流露出现代发展的印迹，闭关洞同时可供6人闭关。

从菩提道一阶梯漫步西行约十余米度母殿便映入眼帘，此殿共供奉佛像21尊，其中主位供奉绿度母，佛像高1.8米，採用本地佘太翠玉石做为专用地砖铺设而成。绿度母殿佛像材料为西藏铜製。

度母殿北侧分别为：护法殿"供奉五大金刚"，藏传佛教五大本尊的观修，其功德是护持正法、摧毁魔君、除障，所做之事可很快得到成功，并得到好的结果。祖师殿供奉释迦牟尼、米拉日巴大师、宗喀吧大师，释迦牟尼是佛教创始人，其功德是解除众生的无明黑暗，领悟缘起真理，解脱生死苦海，证德无上正等正觉。米拉日巴大师作用为：引导精进修学，可消灭众生之诸恶业罪障得令清净。能破一切烦恼，增长无量无边的福智，具有即生成就的榜样作用。宗喀巴大师其作用为：帮助凡人消除"恶业"，给予大众智慧及无穷的力量。他改革了西藏传统佛教不清净的思想，建立了以"戒"为根本的清净休学的无尚真理。财神殿供奉藏巴拉财神，。

东至菩萨殿殿内共供奉佛像3尊，"四壁观音、金刚手菩萨、文殊菩萨"，四壁观音是雪域西藏的守护神，其功德为：赐予大慈大悲，改变自己，放弃自私，生起大爱，快乐众生。常得吉神拥护，夙生怨对，鹹蒙法益，而得解脱，永免寻仇报复之苦。主位左侧供奉金刚手菩萨，金刚手菩萨是诸佛菩萨力量的总集。其作用是消除无数的妨碍，增加无穷的力量。如遇到修行妨碍，或者面临中阴的恐怖，只要忆念金刚手菩萨，就能使这些违缘全部遣除。主位右侧供奉文殊菩萨，其作用是解除人愚痴，开达智慧，主要针对求学者，最起作用的就是般若智慧。

菩萨殿北侧分别为：地藏殿，供奉地藏菩萨或地藏王菩萨，三圣殿供奉"阿弥陀佛、药师佛、长寿佛"。莲师殿，供奉莲花大师 ，其功德是以密宗法术一一收服藏地凶神邪祟，使之立誓拥佛法，并能制服邪魔歪道，用他的法力强烈的调服和解除邪恶。他创造显密经院及密宗道场，奠定了西藏佛教的基础。