商务部亚洲司共主管25个亚洲国别，包括: 东北亚4国（日本、韩国、朝鲜、蒙古）、东南亚11国（印度尼西亚、泰国、新加坡、马来西亚、菲律宾、越南、高棉、寮国、缅甸、汶莱、东帝汶）、南亚8国（印度、巴基斯坦、孟加拉国、斯里兰卡、尼泊尔、马尔地夫、不丹、阿富汗）和西亚2国（伊朗、土耳其）。

主要职能是：拟订并组织实施与所负责国别（地区）经贸合作发展战略、规划和政策；建立双边、区域政府间经济贸易联委会、混委会等机制；组织双边、区域经贸谈判；处理国别（地区）经贸关係中的重要事务；监督外国政府履行与我国签订经贸协定情况并承担对外交涉工作，协助中国企业获得外国市场準入；管理与未建交国家的经贸活动。