《微生物学杂誌》创办于1978年，是由辽宁省科学技术厅主管，中国微生物学会、辽宁省微生物学会、辽宁省微生物科学研究院主办的综合性期刊。

据2018年12月《微生物学杂誌》期刊官网显示，《微生物学杂誌》第七届编委会共有编委57人。

据2018年12月30日中国知网显示，《微生物学杂誌》出版文献共4586篇，总被下载729590次、总被引29920次；（2018版）複合影响因子为0.601，（2018版）综合影响因子为0.450。据2018年12月30日万方数据知识服务平台显示，《微生物学杂誌》文献量为2618篇，被引量为17624、下载量为125870；根据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《微生物学杂誌》2015年影响因子为0.964。