商会成立的主要宗旨是为促进新中医药保健品的贸易与交流、举办展览会、组织贸易考察团、维护会员的利益及协调会员之间的商业纷争、举办或参与举办培训活动，提高会员专业知识，促进行业资讯交流等。

与中国签署友好合作交流协定有：中国医药保健品商会《合作协定》、四川省医药对外交流促进会《中药合作交流备忘录》、四川成都中医药大学《合作意向书》、亳州市政府《合作意向书》、亳州市药业总会《友好关係协定书》、通化市国际贸易促进委员会《产品经销协定书》、中国医药保健品商会《关于代理医药产品注册和认证的合作协定》、中国云南省国际商会医药保健品分会《合作协定书》等。