公元1384年享有勃艮第领地的佛兰德公国路易二世过世后，法国华洛亚王朝的一个分支，一位年轻的贵族继承勃艮第的领地，公国的女性继承人－佛兰德的玛格莉特三世，早在公元1369年下嫁给这位贵族－菲利浦二世，他顺理成章的被法国国王约翰二世受封为勃艮第公爵，同时却利勃艮第的首府位于第戎，并且把佛兰德地区併入公国的领地内，低地国家从此进入勃根地统治的时代。

在之后的数十年，勃艮第大举取得神圣罗马帝国在低地国的领土，在菲利普三世主政时期,他利用联姻、战争等手段大大扩张了勃艮第公国的势力，特别是整个吞併了低地国家。从1428年到1443年，他相继吞併了属于低地国家的埃诺、荷兰、布拉班特、林堡、卢森堡等伯国；低地国家成为勃艮第的经济支柱。公元1463年菲利普三世首次在尼德兰召开了三级会议。从此勃艮第公国的政治中心已经实际从第戎转移至尼德兰。 公元1477年查理公爵在南锡战役阵亡，然而在其临终前并未留下男性继承人，法王路易十一世利用封建法度，把勃艮第的大部分领土收归为法国的领地，而查理之女玛丽在其未亡之时已经嫁给奥地利大公－马克西米连，使奥地利获得勃艮第残余的领地，包含尼德兰地区的低地国家也随之併入奥地利的领土，此举不难想像会和法国产生冲突，公元1479年双方在法国北方爆发冲突，奥地利获胜然而他们只取得佛兰德地区为止，公元1482年双方签订条约并且停战。 之后玛丽之子－菲利浦一世在其父的安排开始接管勃艮第遗产，并在公元1492年他和卡斯蒂利亚的公主胡安娜结婚，之后他从既有的领地尼德兰进军伊比利半岛，并担任卡斯蒂利亚的国王最后终于统一西班牙。

以下是从统治过尼德兰的勃艮第公爵：

菲利普二世 (勃艮第):法王约翰二世之子，妻佛兰德的玛格莉特。约翰 (勃艮第公爵)(1405-1419)菲利普三世 (勃艮第)(1419-1467)大胆的查理(1467-1477)

勃艮第的玛丽(1477-1482):大胆查理之女，下嫁给奥地利大公，亦即日后神圣罗马帝国皇帝马克西米连。

腓力一世 (卡斯蒂利亚)(1482-1506):玛丽之子。查理五世 (神圣罗马帝国) (1506-1555):腓力之子，在晚年退位。

尼德兰地区有着各个自治城市和主教管理，在地方事务上有强势的地方派系，以致于独立的意识逐渐崛起，不同的税制、度量衡使得地方权力的被限制，公爵在长是扩大在此地的控制力时，往往和独立的市镇（以及支持独立的贵族）发生血腥冲突，勃艮第公国在尼德兰的领地设有一个现代化的中央政府，这个政府会设定议会（仿效法国的三级会议），菲利浦三是在扩展自己对南尼德兰的控制时，便使布鲁塞尔等城市纳为自己的控制下，并借着议会的力量控制改变传统独立城市的地位，以及控制该地区的经济状况。 公元1464年一月九日首次的议会在布鲁日召开，与会者有布拉班特公国、佛兰德公国、里尔、荷兰、西兰、梅赫伦以及法国北部一些城市。

从公元1441年菲利浦三世掌握布鲁塞尔后，布鲁日成为商业的中心，然而在15世纪的80年代这座城是因为港口淤积而结束经济霸权，菲利浦转而赞助文学以及绘画领域，大幅提升该地的文艺层次。

公元1491年到公元1492年荷兰爆发农民起义，这次革命由萨克逊公爵亚伯特三是率领的军队所镇压。