王飞2008-2010赛季效力广州富力足球队（长沙金德），之后球队从中超降级。2011年初，王飞选择留洋，曾在西班牙足球乙级联赛球队赫罗纳试训，随后在奥地利联赛打了5个月。2012年1月15日，上海申花足球俱乐部宣布签下此前在长春亚泰试训的小将王飞，成为了上海申花在2012年的内援第一签。2015年7月10日下午，中超上海绿城申花俱乐部通过其官方微博中宣布，球员王飞将被球队租借至中甲呼和浩特中优足球队。2016赛季租借期满回归上海申花足球队。2017赛季租借至上海聚运动足球队。2018年2月6日加盟青岛黄海足球俱乐部。