在山西医科大学领导下运行，目前尚未按公司化注册和运作，亦没有独立的财务。中心实行由学校领导下的中心主任负责制，目前由药学院院长李青山教授代理主任。

中心实行以开发项目为纽带的科研开发体制，实施课题组长负责制，主要依託山西医科大学药学院的设备及人才资源。中心设中药製剂、中药材GAD等6个研究开发部。

中心主任首席学科带头人李青山教授为理学博士生导师。现为山西医科大学校长助理，药学院院长，国务院政协特殊津贴获得者，山西省新药评审委员会副主任委员。

中心正在研製的新药科研开发项目20余项，包括国家一类抗癌新药的研製项目，国家自然基金项目、省攻关项目等。目前正在研製国家一类新药1个，二类中药新药3个，三类中药新药4个。取得省级科技进步一等奖3项、二等奖1项，获发明专利5项。这从一个侧面显示了中心和药学院在现代中药新药研究领域所具备的科技水平和能力。