1996年成为全国首批三家"国际企业孵化器"之一；1998年被科技部评为国家首批十家国家级"高新技术创业服务中心"之一；同年，由国家教育部、科技部等单位联合组建了"中国苏州留学人员创业园"。

苏州高新技术创业服务中心成立至今，已累计拥有孵化场地15万平方米，累计孵化企业1000余家。聚集科技人员8000多人，具有中、高级职称的1300多人，引进留学人员600多人，其中博士200多人、硕士近400多人。开发高科技项目1000余项，其中包括国家"863"项目9项，"973"项目1项，国家攻关项目、火炬计画数项。在历年的科研开发中形成了近200项国家专利。毕业企业近300家；累计实现销售收入140多亿人民币。

十年风雨兼程，硕果与荣誉承载腾飞的梦想前行！1999年底创业中心被共青团中央授予"中国青年科技创新行动示範基地"。2000年11月被国家科技部、人事部和教育部联合评定为"全国留学人员创业园示範建设试点"。2001年5月，国家三部一局联合授予"国家级示範园"称号，9月，被科技部授予"国家级孵化器先进单位"，年底被江苏省政府评为先进单位，并连续三年在江苏省科技孵化器网路评比中荣获第一名。

2002年被中国侨联授予"中国侨联科教兴国示範基地"的荣誉称号。2003年4月成为国内首批创新基金小额资助依託试点单位之一， 9月被中央和国务院六部委授予"全国留学回国人员先进工作单位"，同月还被国家科技部授予"火炬计画十五周年先进集体"的荣誉称号。2005年2月，新药创製中心中试平台作为国家专家孵化器专业技术孵化平台列入国家火炬计画，同年4月，被评为首批国家创新基金创业项目服务机构之一。

在苏州高新技术创业服务中心、苏州国际企业孵化器和苏州留学人员创业园形成的一体化组织管理机构的基础上，孵化器的发展结合高新区的"二次创业"逐步形成了自身的专业化和产业化特色，建立了若干个专业孵化器和产业园。