吴清源，出生于民国年代的围棋神童。11岁的他成为北洋军阀段祺瑞门下棋客，以天才棋艺养活家人；14岁初渡日本，乍来即与日本棋院大赛刚出炉的冠军较量，并中盘获胜；五年后，吴清源与日本新锐棋手共同创立围棋新布局，掀起一场围棋革命。1939至1956年间，吴清源凭个人之力打低全日本最顶尖的七位超级棋士，十次大胜“十番棋”，被誉为“昭和棋圣”。他以“95盘擂台赛式”的“十番棋”，令当时日本棋坛所有大师全部降级，创造了日本围棋界所称的“吴清源时代”。老年的他更发明“21世纪围棋”，抛弃其功利性，改为提倡其艺术价值，揭示围棋的高远境界。

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这部影片的拍摄场地，部分在中国，部分在日本。演员和剧组成员汇聚了中国、日本和台湾两国三地的成员。导演田壮壮招来旅外文人阿城担任编剧，

2004年10月初剧组抵达日本开始确定拍摄地点及场景，《吴清源》剧组整整忙碌了近10天才开始正式拍摄，拍摄的第一场戏地点选择在小田原吴清源的故居。小田原距东京不远，乘新干线1个多小时的路程，吴清源夫妇和摄製组同行。小田原是吴清源1956年购买的房子，房子坐落在半山腰上，天气好的话，站在山上，还可以看得见大海。在小田原拍摄的一个镜头是，吴清源夫妇身着中国传统服装，和分别扮演剧中吴清源夫妇的张震与日本影星伊藤步轻鬆聊天，这是电影《吴清源》全片中的第一个镜头。

2004年10月15日起，《吴清源》剧组移至近江八幡，这里是京都府的一个内陆城市。剧组在这里拍摄了电影中绝大部分镜头。之所以最终选择在这里拍摄，是因为旧东京原貌在二战大轰炸之后已经再也看不到了，近江的老房子及寺院相对而言保存较好，可以解决全片大部分的内外景。近江是个很美丽的城市，剧组在那里驻扎下来进行长达两个多月的拍摄，首先拍摄的是吴清源的师父濑越宪作与吴清源一起生活的场景镜头。

因为是拍摄在日本也有着巨大影响力的吴清源电影，近江市政府非常重视，影片拍摄过程中专门成立了一个支持电影拍摄的办公室，主要是帮助剧组联络场地，组织民众演员，儘可能地为电影拍摄提供良好的条件，这也让田壮壮、刘小淀他们再次感受到吴清源超越国界与民族的魅力。

配合影片平缓的节奏，用美丽的画面传达出无与伦比的感伤氛围，简洁的人物对白则流淌出东方的诗意（《国际综艺》、《综艺》、义大利安莎通讯社评），承担寂寞，在平凡的人生中体现伟大的情怀（上海国际电影节评审会评）。

田壮壮导演尊重吴清源尽人皆知，也许是太尊重了，导演小心翼翼地撷取了吴清源生命中的若干片段，採取灰绿的冷色调加以表现。日本的园林优雅宜人，环境在影片中充当了重要的角色，甚至比人物本身还要重要，或许，这就是导演试图表现的味道，这清冷的色调确实养眼，也确乎使人安静。这些片段在影片的结构中几乎是完全平行的，并没有被纳入到一个可以期待的结构中。感受不到辉煌，自然，也无法触摸到吴清源的精神境界，感受到他如何通过一盘棋，在精神上所发生的变化和成熟。

于是，影片变成了单纯而安静的流逝的过程：一个一个优美的冷色调片段随风而逝，偶尔，吴清源的造型会给观众留下深刻的印象。然而，这些片段、形象，毕竟是匆匆、太匆匆了，未等观者感受、触摸到吴清源的内心世界，影片已在字幕中突兀的转向吴清源的下一段人生。

导演放弃了一切技巧，影片《吴清源》，被拍成了情景重现式的纪录片，然而，吴氏的人生和棋局，或许还不如纪录片的方式表现得更清楚。毕竟，电影有着自己独特的节奏，无法如同纪录片插入大量的直接的讯息。导演确乎将含蓄内敛的风格发挥到了极致，然而，影片却没有在这含蓄的表象下面潜藏吴氏人生的激流。影片平淡至极，而平淡，并不就是吴清源人生的全部味道。那以生命来下棋、那轰动日本媒体的辉煌、那精神和智慧的决战、那乱世中灵魂的追求、那疗养院中感受的自然和谐之美、那通过激战方能悟到的胜负真谛，对21世纪最美一子的描绘，这一切，不是平淡和简单的情景重现，就能够表现出来的。

电影《吴清源》，努力做到了安静、无言，然而，在这些安静美丽的影像中间，空还是空，而不是了悟和了悟之后有力的静穆（北京青年报评）。