内蒙古自治区科学技术协会是1958年11月在内蒙古自治区科学技术普及协会和中华全国自然科学专门学会联合会内蒙古分会的基础上成立的，是中国科学技术协会的地方组织，是中国共产党内蒙古自治区委员会领导下的人民团体。

据2018年7月内蒙古自治区科学技术协会官网显示，协会拥有自治区、盟市、旗县（市、区）、乡镇苏木（街道）四级科协组织1116个。自治区12个盟市科协全部独立建制，101个旗县（市、区）科协，独立建制的有76个。有组织机构37223个，其中：基层科协112个，企业科协140个，自治区级学会90个，团体会员2306个，街道、乡镇科普协会1156个，农技协3967个，青少年科技教育机构58个，各类科普场馆、科普教育示範基地、示範学校、科普活动站（青少年工作室）6464个，科普网站86个，科普从业人员17400人，各类科普协会拥有个人会员57万人，其中中级以上职称7万人。